De politiechef zei dat de verdachte deze maand vier overvallen had gepleegd en dat er een arrestatiebevel tegen hem liep in verband met een eerdere zware overval.
De schietpartij vond donderdagavond plaats in het blok 1400 van Cantrell Drive aan de South Side.
Volgens McManus hielden agenten de man in de gaten, waarna hij een winkel beroofde.
De undercoveragenten wilden de man aanhouden op een adres waarvan ze dachten dat hij daar zou zijn, maar besloten in plaats daarvan een verkeerscontrole uit te voeren, aldus McManus.
Toen agenten de man wilden aanhouden, reed hij door het blok langs Cantrell Drive en vluchtte uiteindelijk te voet, aldus McManus.
Nadat ze tegen een hek waren gerend en een wapen op de politie hadden gericht, schoten de agenten de man neer, aldus McManus.
Volgens de politie werd de man ter plaatse dood verklaard.
Dit was donderdag de tweede schietpartij waarbij politieagenten in San Antonio betrokken waren.
Bij de laatste controle is nog niet duidelijk wie de vrouw is en welke aanklachten haar mogelijk ten laste worden gelegd.